倪光南院士的個性特點與決絕的態度，雖然在一定程度上幫助他走向了成功，但也正因為如此，他曾在某些關鍵時刻未能做出適當的妥協，最終導致了自己的失敗。可以說，這一失敗成為了時代的遺憾，而當時的局勢也使他別無選擇。周光召院士曾在后來的訪談中提到，倪光南和柳傳志之間已經發展到了水火不容的地步，局勢逼迫他們不得不做出二選一的抉擇。盡管改革開放已經走過了許多年，但能夠突顯個人能力和潛力的企業家依然稀缺；相比之下，像倪光南這樣的科學家卻很多。倪光南將工作中的分歧提升到個人名譽受到攻擊的層面，這顯然是錯誤的。在隨后的調查中，也證明柳傳志并沒有那些被指控的言論。

回到建國初期，倪光南年僅11歲時便隨父母從老家遷往上海，在這個繁華的都市中度過了不少時光。1961年，倪光南以優異的成績從南京工學院（現東南大學）畢業，并順利進入中國科學院計算技術研究所工作。在這里，他從事了長達二十年的科研工作。倪光南扎實的技術功底和認真負責的工作態度得到了領導的高度認可。1981年，他應邀赴加拿大國家研究院工作，而在兩年后的1983年，他決定回國，將自己的技術專長貢獻給祖國。

倪光南帶回國的，不僅僅是知識的積淀，還有他親手挑選的漢字微機所需的一些零部件。基于這些零件，他經過一年的研究和開發，成功推出了震動國內外的“聯想式漢卡”。這一突破性成果的問世，標志著1984年中國科技領域的一個里程碑。同年，柳傳志和另外10位伙伴成立了中國科學院計算技術研究所新技術發展公司，初始資金為20萬元。

公司成立后，柳傳志邀請倪光南加入，并帶領他與漢卡團隊一起加入了新公司。二人在公司中分別負責戰略管理和技術研發，正是憑借他們的默契合作，公司經歷了輝煌的十年。在這期間，倪光南和柳傳志被譽為科技界的“雙子星”。隨著“聯想式漢卡”聲名遠揚，公司也隨之改名為北京聯想新技術發展公司。

1990年代初，柳傳志結識了從英國留學歸來的呂譚平。呂譚平與幾位朋友共同成立了代理外國元器件的香港導遠公司。在此期間，柳傳志與呂譚平建立了業務關系，兩者相互支持，進一步拓展了各自的事業。1987年，考慮到計算機產業的零部件需求和銷售形勢，柳傳志與呂譚平商議，決定在香港成立一家公司，專門負責北京聯想公司生產的微機銷售，并代理國外元器件。然而，由于資金問題，創辦公司并非易事。幸得柳傳志父親的幫助，借助國家信譽，最終成功成立了中國科技轉讓（香港）公司。該公司能夠從銀行貸款，并享有外匯配額。于是，香港聯想公司順利成立，其中北京聯想、香港導遠公司和中國科技轉讓公司各持股33.3%。

然而，進入90年代初期，北京聯想的發展遇到了一定的瓶頸。全球互聯網的沖擊掀起了劇烈波動，許多互聯網公司紛紛裁員，經濟損失慘重。與此同時，外國產品大量進入中國市場，聯想也受到了一定的壓力，公司的前景變得模糊不清。如何找到突破口，成為了眾人思考的問題。柳傳志認為，應該充分利用中國制造的優勢，發展自主品牌；而倪光南則主張技術路線，著重發展芯片產業。倪光南已經開始著手建設芯片設計中心，滿懷信心地推進項目，然而，他的努力屢屢受阻。由于公司收入的近一半被投入技術研發，卻未見成效，許多高層管理人員對其產生了不滿。尤其是常務副總裁李勤，有意“刁難”技術研發工作。這使得倪光南感到憤怒，并試圖尋求柳傳志的調解，卻不料遭到拒絕。此后，倪光南與柳傳志的關系逐漸惡化。

在香港聯想公司成立后，由于其發展迅速，1994年，香港聯想公司成功在香港交易所上市。然而，由于上市條件嚴格，需要增資擴股，而香港導遠公司并沒有足夠資金。在柳傳志父親的幫助下，柳傳志從北京聯想公司調撥了1270萬美元，其中約550萬美元被借給香港導遠公司，最終順利完成增資擴股。香港聯想公司成功上市，這筆資金的“來源”引起了倪光南的懷疑。于是，他多次實名舉報，指控柳傳志存在經濟問題。隨后的調查引發了更大的風波，柳傳志與倪光南的關系已經徹底破裂。

調查結果公布后，北京聯想公司召開了內部會議，明確指出技術研發和項目立項應由總負責人控制，強調柳傳志在公司決策中的權力。倪光南提出的指控被認為缺乏證據，很多問題不符合事實，甚至有些顯得輕率和不負責任。盡管柳傳志和倪光南曾有過一段深厚的合作關系，并一度成為其他科技企業的榜樣，但最終的局面令人感到惋惜。最終，會議決定解除倪光南的總工和董事職務。

1996年左右，由于呂譚平的決策失誤，香港聯想公司出現了較大損失，股票價格一度大幅下跌。為了挽救局面，柳傳志決定將北京聯想的優質資產注入香港聯想，并通過一系列操作，在香港再次進行了二次上市。上市后，香港聯想的股價飆升，柳傳志和香港導遠公司各持有53.3%和43.3%的股份，其余的股份由中國科技轉讓公司持有。呂譚平因此也從中獲益，償還了先前的債務。

倪光南在被解除職務后，多次向上舉報，吸引了上級領導的關注。經過隨后的調查，相關單位認定倪光南所提出的問題僅僅是工作中的疏漏和不足，并未發現任何違法違紀行為。最終，公布的結果是，倪光南被解聘，但他仍得到了500萬的補償。在獲知這一結果后，倪光南寫了一封長長的道歉信。

柳倪之爭雖然畫上了句號，但時過境遷，聯想集團在隨后的幾年里完成了股改。柳傳志在幾輪股份變動后，個人持股比例大幅上升，這引發了“國有資產流失”的輿論聲浪。有人認為應當對倪光南進行適當的補償，甚至提出可以分一部分股份給他。曾經平息的柳倪之爭再度成為公眾話題，而當時的領導層逐漸年老，尤其是周光召院士，重新陷入了公眾視野。當前國際芯片領域的爭議再次激起了國內的輿論風波，倪光南院士的支持者逐漸增多，局面再次變得復雜。