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新智元報(bào)道
編輯:peter東 KingHZ
天才少年用AI日篩十億分子!奧特曼恩師支招:不買模型賣授權(quán)。
為了吃到蔬菜水果,人類在土地上傾倒了越來越多的農(nóng)藥:三十年間用量翻了一倍,卻仍有40%的作物每年死于病蟲害。
兩位剛成年的創(chuàng)始人給出了一個(gè)截然不同的答案——把農(nóng)藥研發(fā),當(dāng)成「精準(zhǔn)靶向治蟲」。
通過AI模型先在海量蛋白質(zhì)中鎖定只存在于害蟲體內(nèi)的「獨(dú)特靶點(diǎn)」,再用類似AlphaFold的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與配體篩選技術(shù),為這些靶點(diǎn)設(shè)計(jì)專屬「藥」,讓殺蟲劑第一次有機(jī)會(huì)做到:只殺害蟲,不誤傷人類與有益生物。
為植物找藥,為全球省糧
一個(gè)事實(shí)令人吃驚,但鮮為人知:為了達(dá)到2000年時(shí)相同的農(nóng)作效果,如今全球農(nóng)藥使用量竟然翻了一倍。
問題不在農(nóng)民,而是害蟲演化得太快,抗藥性越來越強(qiáng),遠(yuǎn)超農(nóng)藥研發(fā)的速度,導(dǎo)致農(nóng)藥效果越來越差。
但我們不能輸給進(jìn)化這場(chǎng)賽跑。
監(jiān)管機(jī)構(gòu)也在給農(nóng)藥制造商越來越大的監(jiān)管壓力,但大多數(shù)農(nóng)化公司仍然依賴調(diào)整傳統(tǒng)化合物。
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具體來說,目前大多數(shù)殺蟲劑的開發(fā)方式并非基于特定的靶點(diǎn),而是昆蟲學(xué)家和化學(xué)家提出不同的化合物,然后在昆蟲上進(jìn)行測(cè)試。為了檢查其有效性,通常需要合成和測(cè)試數(shù)千種化學(xué)物質(zhì),成本很高。
而兩位創(chuàng)業(yè)者堅(jiān)信「苦澀的教訓(xùn)」——即「利用計(jì)算資源的通用方法最終效果最好,而且往往遠(yuǎn)勝于其他手段」。因此,他們不再基于已知或假設(shè)的屬性來運(yùn)用人類知識(shí)生成蛋白質(zhì)和小分子,而是利用海量數(shù)據(jù)訓(xùn)練的基礎(chǔ)模型。
于是,他們決定把已經(jīng)在藥物研發(fā)中得到驗(yàn)證的AI方法,應(yīng)用于農(nóng)藥分子設(shè)計(jì),讓它比傳統(tǒng)研發(fā)快上幾個(gè)數(shù)量級(jí),還更安全、更有效。
他們已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了以下里程碑:
構(gòu)建了可統(tǒng)一處理蛋白質(zhì)與小分子相互作用的基礎(chǔ)模型,具備通用不確定性評(píng)估能力
研發(fā)出一個(gè)比AlphaFold快4倍的蛋白質(zhì)折疊模型,專門用于農(nóng)藥靶點(diǎn)分析
在加州圣卡洛斯實(shí)驗(yàn)室剛剛建成后的三周內(nèi),就識(shí)別并驗(yàn)證出首個(gè)專有農(nóng)藥的候選化合物
少年創(chuàng)業(yè),為糧食造藥
2024年,18歲的Tyler Rose和19歲的Navvye Anand共同創(chuàng)辦了Bindwell 。
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Bindwell將人工智能驅(qū)動(dòng)的藥物研發(fā)技術(shù)應(yīng)用于農(nóng)業(yè),目標(biāo)是加快新型農(nóng)藥分子的篩選與測(cè)試流程。
最初,Bindwell源自2023年。當(dāng)時(shí),兩人正在參加沃爾夫勒姆暑期研究計(jì)劃(Wolfram Summer Research Program),專注于一個(gè)名為PLAPT的藥物研發(fā)AI模型,研究方向?yàn)榻Y(jié)合親和力預(yù)測(cè)(binding affinity prediction)。
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預(yù)印本:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.08.575577v3
這項(xiàng)工作后來還被《自然·科學(xué)報(bào)告》(Nature Scientific Reports)的一篇癌癥治療論文引用。
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到了2024年,他們開始嘗試將這一方法遷移至農(nóng)藥研發(fā)領(lǐng)域。
兩位創(chuàng)始人都曾親身接觸過農(nóng)業(yè)中的害蟲防治問題。Rose從他的在中國務(wù)農(nóng)的姑姑那里了解到害蟲控制的挑戰(zhàn)。Anand來自旁遮普,親眼目睹了有限的農(nóng)藥選擇如何影響作物產(chǎn)量。
2024年,18歲的Rose和19歲Anand創(chuàng)立的Bindwel。
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該公司將人工智能驅(qū)動(dòng)的藥物發(fā)現(xiàn)技術(shù)應(yīng)用于農(nóng)業(yè),目標(biāo)是加快新農(nóng)藥分子的識(shí)別和測(cè)試速度。Bindwell進(jìn)入了Y Combinator 2025年冬季項(xiàng)目,計(jì)劃構(gòu)建AI模型并向主要農(nóng)化公司出售其訪問權(quán)限。
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但他們并沒有多少進(jìn)展——大多數(shù)殺蟲劑行業(yè)的從業(yè)者不愿意將AI作為農(nóng)藥發(fā)現(xiàn)的核心部分。
在項(xiàng)目中期,他們受邀到Y(jié) Combinator創(chuàng)始人Paul Graham的家中,在露臺(tái)上與他進(jìn)行了大約45分鐘的談話。
在聽到他們的難題后,Graham提出了不同的方法:與其銷售工具,他們可以利用自己的模型親自發(fā)現(xiàn)新的農(nóng)藥分子,并直接許可知識(shí)產(chǎn)權(quán)。
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隨后,Graham在X上發(fā)文稱:「Bindwell的創(chuàng)始人應(yīng)該會(huì)做得不錯(cuò)。他們聰明,點(diǎn)子也很好。」
接受了Graham的建議,Bindwel調(diào)整到了新的商業(yè)模式,并在種子輪融資中籌集了600萬美元,由General Catalyst和A Capital聯(lián)合領(lǐng)投,Graham本人也親自投資。
順便一提,Graham是奧特曼的伯樂,曾認(rèn)命奧特曼為Y Combinator的高管,多次力挺奧特曼。
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蛋白質(zhì)AI:從諾獎(jiǎng)到農(nóng)藥
Bindwell為農(nóng)藥設(shè)計(jì)開發(fā)了一套自有的AI套件,旨在減少幻覺。
該軟件包括
結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型Foldwell,受DeepMind的AlphaFold啟發(fā)的定制擴(kuò)散模型,用于識(shí)別目標(biāo)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu);
APPT,一個(gè)用于生物農(nóng)藥篩選的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用模型。
這兩個(gè)工具的目的,是找出害蟲特有,且與其它害蟲所需蛋白緊密互作的靶點(diǎn)蛋白,一旦找到這些蛋白質(zhì),你就可以設(shè)計(jì)出能與它們結(jié)合并阻止它們發(fā)揮作用的東西。
而這便是PLAPT,一個(gè)開源的蛋白質(zhì)-配體相互作用模型所做的。
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它能夠在六小時(shí)以內(nèi)掃描所有已知的合成化合物,找到目標(biāo)蛋白的合適配體,找到的配體可以作為潛在的農(nóng)藥候選分子。
據(jù)報(bào)道在,Affinity Benchmark v5.5 上,Bindwell的AI工具優(yōu)于現(xiàn)有工具1.7倍。該工具可以一次分析「數(shù)十億」個(gè)分子,性能比DeepMind的AlphaFold-3快四倍。此外,該套件還集成了一個(gè)不確定性量化系統(tǒng),用于標(biāo)記結(jié)果何時(shí)可信以及何時(shí)需要更多數(shù)據(jù)。
目前,Bindwell正在實(shí)驗(yàn)室中測(cè)試其AI生成的分子的有效性。它還在與第三方合作伙伴合作,以進(jìn)一步驗(yàn)證模型。
它還正在與幾家全球農(nóng)化公司進(jìn)行早期討論,預(yù)計(jì)首筆合作將在不久后達(dá)成。一年之內(nèi),Bindwell希望與其中一些公司開始進(jìn)行許可協(xié)議,將AI設(shè)計(jì)出的農(nóng)藥分子作為產(chǎn)品授權(quán)農(nóng)藥生產(chǎn)商使用。
此外,Bindwell也在和中國和印度的相關(guān)機(jī)構(gòu)商談,以進(jìn)行實(shí)地測(cè)試。
另類AI創(chuàng)業(yè)
對(duì)于將生物制藥領(lǐng)域使用AI的模式用于農(nóng)藥設(shè)計(jì),這從原理上是可行的,也可算得上是卷的飛起的行業(yè)對(duì)傳統(tǒng)產(chǎn)業(yè)的降維打擊。
如果真能設(shè)計(jì)出如圖精準(zhǔn)治療的抗腫瘤藥物那樣只殺害蟲,對(duì)人和益蟲無害的新式農(nóng)藥,那無疑將是巨大的成功。
不過農(nóng)藥設(shè)計(jì)和制藥畢竟有所不同,自然界中的生物眾多,如果AI設(shè)計(jì)的殺蟲劑只是檢索了有限的數(shù)據(jù)庫,那其可能會(huì)對(duì)某些本土物種造成傷害。
大規(guī)模推廣之前,還是要謹(jǐn)慎測(cè)試。
AI把原本十年一代的農(nóng)藥研發(fā),壓縮為可以用算力迭代的搜索問題——背后是資本、算力與傳統(tǒng)農(nóng)田的正面相撞。
參考資料:
https://techcrunch.com/2025/11/13/teen-founders-raise-6m-to-reinvent-pesticides-using-ai-and-convince-paul-graham-to-join-in/
https://bindwell.ai/posts/defeating-pests-with-ai
https://x.com/deedydas/status/1989063077095162291
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